癌癥是目前死亡率最高的疾病之一，科學(xué)家們一直都在尋找治療癌癥的方法。近年來(lái)，免疫治療技術(shù)得到飛速發(fā)展。癌癥研究一般從實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)各種各樣的細(xì)胞系開(kāi)始，通過(guò)不同藥物對(duì)這些細(xì)胞的殺傷效果，評(píng)估藥物的療效。這些細(xì)胞是科研人員通過(guò)不同的渠道獲得，通過(guò)構(gòu)建癌癥模型進(jìn)行癌癥生物學(xué)和開(kāi)發(fā)潛在的治療方式，但是很少有人去驗(yàn)證這些細(xì)胞系是否正確。

近期發(fā)表于Genome Medicine一篇題為“Evaluating the transcriptional fidelity of cancer models”的文章，開(kāi)發(fā)一種新的、自主學(xué)習(xí)的計(jì)算模型，借此評(píng)估不同癌癥研究模型與原生腫瘤相似性。研究結(jié)果顯示，在幾種常用的腫瘤研究模型中，在培養(yǎng)皿中生長(zhǎng)的人類癌細(xì)胞系在基因上與人體內(nèi)的癌細(xì)胞最不相似，基因工程小鼠細(xì)胞與人體的相似性更高。

RNA是遺傳表達(dá)信息，不受變異的影響。研究人員從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)獲得相關(guān)數(shù)據(jù)，包含數(shù)百例腫瘤患者樣本的RNA表達(dá)信息，以及相應(yīng)的分期、分級(jí)等腫瘤信息，確定22種可研究的腫瘤類型，對(duì)來(lái)自世界各地實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的657個(gè)癌細(xì)胞系、415個(gè)異種移植物、26個(gè)基因工程小鼠和131個(gè)類腫瘤模型進(jìn)行分析。

研究人員使用0-1評(píng)分方法對(duì)不同腫瘤模型和原生腫瘤相似性進(jìn)行評(píng)估，發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的癌細(xì)胞系平均評(píng)分要低于異種移植物、基因工程小鼠和類腫瘤模型。這可能是由于生長(zhǎng)環(huán)境之間的差異性造成的。因此建議研究人員在進(jìn)行癌癥研究之前需要對(duì)細(xì)胞進(jìn)行慎重選擇。

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